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FISH探针用于检测遗传缺陷的范围不断提高 | |||
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近日,被检测出所有24条染色体同时在中期染色体用只有五荧光标签。4,5例如,使用三个荧光标签,以确定七个不同的间期核中染色体非整倍体第27页的图A所示。当每个组合由不同比例的每个荧光团的标签,检测到的目标的数量是有限的能力来区分不同的标签的比例。例如,8条染色体被再现地检测到只用两个荧光团标记。
FISH探针用于检测遗传缺陷的范围不断提高例如,组成的串联重复的人DNA序列,如着丝粒α-卫星序列的探针通常用来识别或列举具体的染色体。可用于克隆,独特的序列的DNA区域的探针来检测的小区域或位点的基因组。这些克隆的混合物可用于染色,或“漆”,大内的整个染色体。这种染色允许分析以及鉴定中期细胞的补充和易位染色体数目。这些探头所提供的信息,使他们的价值在评估的应用范围,包括产前/围产期诊断,遗传异常,癌症的研究,髓系疾病的诊断,以及罕见的细胞分析基因组。
胎教/围产期应用染色体异常,如唐氏综合征,是迄今为止最常见的遗传异常与新生儿出生缺陷相关。传统的细胞遗传学带状中期染色体上一直是标准的为妇女提供产前测试胎儿染色体异常的风险增加。细胞遗传学检查染色体非整倍体和结构异常,但是,这种技术需要一个大标本量,文化胎儿细胞数天,隔离中期利差,和训练有素的技术人员,对结果进行分析。此外,该方法通常需要超过一周内完成。相比之下,鱼进行一组染色体特异性探针只涵盖最常见的非整倍体(即性染色体或染色体为13,18,和21三体异常),具有很高的灵敏度和特异性,可以检测到这些主要的染色体缺陷未培养羊水细胞中少于24小时。6因此,在某些临床情况下,最常见的非整倍体的快速检测,间期核FISH提供了一个初始的快速屏幕上的完整的细胞遗传学评价。从FISH分析的结果可以用于在一个繁忙的细胞遗传学实验室的情况下,通过将传统的细胞遗传学方法进行分析的列表的顶部通过FISH阳性标本的优先级。
使用直接标记DNA probes.Standard的细胞遗传学分析的六个步骤进行FISH鱼在围产期的设置,是用来检测结构和数值的染色体异常。围产期测试来检测小染色体缺失往往错过了常规细胞遗传学,它可以起到抛砖引玉的作用。这样的微缺失综合症测试包括检测缺失7号染色体上,都与威廉姆斯综合征和22号染色体上,都与DiGeorge氏velocardiofacial综合的综合征。
癌症应用FISH迅速地测试间期和中期染色体缺陷的能力使得它特别实用于癌症的研究。在固体肿瘤,常规细胞遗传学很少使用,因为很难获得中期分裂的肿瘤细胞进行有丝分裂的可能并不代表。其他分子生物学技术,如PCR和南方,北方,西方的分析,需要提取的组织。提取程序净正常和异常细胞,所以灵敏度较低的和定量的不可靠的比FISH探针。
FISH允许细胞通过细胞分析,从而提供了更敏感的和可靠的评估染色体非整倍体,基因扩增和缺失,染色体易位。一个可靠的测定样品中的扩增的基因是否经常可能只有20?50个细胞与评价。
HER-2/neu基因扩增是乳腺癌复发和生存的一个重要的,独立的预后指标。HER-2/neu基因扩增和过表达与预后不良相关 - 一个较短的无病期以下待遇和总生存期较短。的研究还表明,HER-2/neu过度表达作为标记的肿瘤抗化疗和激素治疗是有用的。因此,对于乳腺癌的管理,HER-2/neu基因扩增有可能预测对治疗的反应和确定治疗方法的选择。
虽然HER-2/neu基因扩增HER-2/neu蛋白的表达和免疫组织化学(IHC)的Southern印迹分析经常被用来定量基因扩增,每个呈现技术和解释性的限制。免疫组化的结果随使用不同的抗体和组织处理,使用不同标准阳性和使用不同的程序。按等。HER-2/neu的一些抗体的性能特征有从6至80%的灵敏度,由于这些固有的技术困难,IHC及Southern blot分析还没有被标准化,得到一致的结果。
鱼是一种替代技术,没有Southern杂交和免疫组化技术和解释性的限制。它可靠地,准确地表示基因扩增。HER-2/neu基因扩增对于定量的鱼,明显的优势是,它直接评估水平放大试样中的肿瘤细胞,而保留其形态特征。
一组研究人员最近分析了队列乳腺癌标本通过各种方法,发现鱼比Southern blot分析更敏感和更准确的比北部和Western blot分析,并有更大的适用性和石蜡包埋组织中的灵敏度比IHC 。对最好的方法(IHC冰冻切片),石蜡切片的鱼的敏感性为97.2%,而其特异性为100%。
髓系疾病
髓性疾病 - 包括慢性粒细胞性LEU kemia(CML),急性髓细胞白血病(AML),增生myelopro的障碍(MPD),骨髓增生异常综合征(MDS) - 常见的染色体异常的三体8。因此,存在该三体综合征,是医师的预后价值。Vysis CEP 8探头(直接标记染色体枚举包含在8号染色体着丝粒区域的α-卫星DNA特异性探针)分析细胞间期和中期的鱼比较标准细胞遗传学分析在一项多中心,双盲,控制研究。四个实验室提供了共364归档骨髓标本检测。本研究的结果,示于表I,体现FISH技术的可靠性。
在管理许多血液系统恶性肿瘤,骨髓移植(BMT)是一个重要的治疗策略成功固化。移植后,以检测是否存在克隆肿瘤细胞遗传学,以评估植入的能力是重要的。虽然许多患者一个稳定的嵌合状态演化之间的供体和受体的骨髓,在别人不稳定的一个形式和最终恶性肿瘤复发,越来越多的出现的宿主细胞在骨髓或外周血循环。
大约一个半所有异源BMTS的性别不匹配。快速和准确的骨髓细胞的遗传性别鉴定提供了一个简单的方法,用于评估的骨髓供体/受体状态。虽然一些方法目前用于本次评估,通过列举染色体X和Y FISH探针可以提供最快速,最容易量化的结果。
的试点研究使用Vysis直接标签CEP X SpectrumOrange / Y SpectrumGreen的DNA FISH探针检测,进行评估骨髓标本谁经历了一个异性骨髓移植139例。8间期FISH分析的临床灵敏度估计为100%。常规细胞遗传学分析的估计为77%,并在某些情况下,的分析被卡住过少。谁经历了同性骨髓移植148例,临床特异性间期FISH分析,估计是100%。测定结果显示,高重现性好,即使在实验室。
表一,试点研究的结果比较Vysis CEP 8(染色体枚举探头)的FISH相间分析与标准检测8号染色体三体细胞遗传学分析。
罕见的细胞分析FISH已被广泛地使用在尝试识别进行产前诊断在母体血液中的胎儿细胞。羊膜穿刺或绒毛取样(CVS)的细胞,胎儿遗传分析材料的传统来源,对胎儿的风险小,但意义重大的牺牲。如果胎儿细胞可以得到,而不是从母体血液中,可能对胎儿无创产前基因检测。比羊膜穿刺术或CVS安全,这样的测试,可能会被用于更大数量的怀孕。
通过筛选使用鱼或PCR与探针作为标记的Y染色体的男性胎儿起源的母体血液样本,研究人员报告值范围从一个胎儿细胞在10 5 10 9核母细胞之一。9,10其他结合IHC检测胎儿血红蛋白11 FISH(荧光免疫表型和间期细胞遗传学,肿瘤的调查作为一种工具)作为一种手段,确定女性胎儿细胞的技术称为小说。
有些报告还引用鱼使用在白血病微小残留病检测。12,13不同于逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),这需要复杂完整的RNA提取,鱼提供了一个细胞细胞分析材料简单地固定在显微镜幻灯片。因此,FISH技术是一种简单的方法量化疾病标本中存在的水平。
实践思考作为诊断行业继续寻找创造性的方式来控制成本,鱼很可能发挥越来越大的作用。鱼提供的能力,在大多数情况下,获得最终的结果迅速通过采用一个简单的检测策略,可以解释的基本的技术人员经过适当的培训。
FISH分析的自动化,将增加检测吞吐量,减少技术人员的时间,除去运营商的偏见,并简化复杂的结果的解释。幻灯片自动制备和染色是可能的。图像处理方法和仪器间期核中的染色体自动枚举已经得到证实。当市售的,自动化的“点计数”将会减轻繁琐的显微镜观察小时的技术人员和消除由于疲劳和误解或计算标准不一致的应用程序的错误。类似那些专为半自动分析常规染色染色体的核型分析系统允许识别荧光带状染色体。这些能力,一旦整合成一个完整的系统,将允许的交钥匙FISH分析系统。
结论鱼在临床研究实验室的效用越来越大。CAP今天在最近的文章中,亚瑟Brothman,博士,犹他健康科学中心,国家大学的细胞遗传学实验室主任,“如果鱼是不是提供一些遗传学评估,病人不给予什么,我相信是标准的护理。“ 14几个驱动因素都使FISH检测进入主流的做法,在病理实验室。这些包括克隆的独特的序列探针的方法的改进,标记核酸,简化检测程序,以允许自动滑动染色,信息密度高,通过使用多色事件的检测,复杂的图像分析工具,以及增加的临床重要性的知识固体肿瘤基因分型诊断,预后和监测。
承认作者非常感谢H.许萍博士沃尔特·王,博士;戴夫巷,博士;拉里·莫里森博士;乌韦·穆勒博士,彼得的Osella;约翰Proffitt,博士;克里斯Shasserre;和Doug塔龙博士的协助下, ,Vysis公司
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