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微生物是生态环境的重要组成部分，而且与工农业生产和人们的日常生活密切相关，在食品、医药、农业生产和环境保护等方面具有广泛的应用，微生物产业已成为继植物、动物之后的第三大生物产业。微生物为生物技术的发展更是提供了基本材料和丰富的基因资源，也是生物技术产业的重要开发对象。
农业微生物是与农业生产(农作物种植业、畜禽饲养业和水产养殖业)、农产品加工、农业环境保护和农业生物技术有关的微生物的总称。微生物菌种资源是指可培养的、有一定科学意义或实用价值的细菌、真菌、病毒、细胞株及相关的信息资料。近几十年来，微生物肥料、微生物农药、微生物调节剂、土壤和环境修复剂、饲料添加剂等农业微生物产品迅速发展，成为发展生态农业、循环农业的重要途径。因此，农业微生物菌种资源是国家重要生物资源之一，不仅是农业微生物科学研究、农业微生物产业及农业生物技术产业发展的基础，而且也是整个农业可持续发展的重要基础。
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